ישיבת באר התחיה מבקשת ליצור בית מדרש חי של התורה הגואלת בעיר האבות בירת הנגב – באר שבע.
הישיבה שואפת לגדל אנשי תורה ואחריות – בוגרים בעלי עומק רוחני, זהות תורנית־ציונית בהירה ועולם פנימי מגובש, המחברים בין עמל בית המדרש לבין נשיאה אמיצה בעול החיים, השירות והחברה הישראלית.
הישיבה רואה בלימוד התורה תהליך של בניין אישיות שלמה, בשירות הצבאי שליחות ערכית, ובהמשך חיי המשפחה והקהילה המשך טבעי של בית המדרש.
מתוך נאמנות לתורה, לעם ולמדינה, שואפת הישיבה להצמיח תלמידים ההולכים בדרך של אמת, אחריות ותחיה מתמדת – אישית ולאומית. סביב הישיבה נבנית קהילה תורנית דתית-לאומית שנותנת מענה חברתי למשפחות תורניות צעירות בבאר שבע, מתוך שאיפה לקחת חלק בהנעת העיר לצמיחה.